Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc47Q9D024 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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