Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Nde1Q9CZA6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nde1Q9CZA6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nde1Q9CZA6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nde1Q9CZA6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nde1Q9CZA6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nde1Q9CZA6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nde1Q9CZA6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nde1Q9CZA6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Nde1Q9CZA6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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