Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms