Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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