Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Utp23Q9CX11 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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