Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxxc1Q9CWW7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxxc1Q9CWW7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms