Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pin4Q9CWW6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pin4Q9CWW6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms