Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWS1

Rnf135, E3 ubiquitin-protein ligase RNF135, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf135Q9CWS1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf135Q9CWS1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf135Q9CWS1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms