Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cnot11Q9CWN7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cnot11Q9CWN7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cnot11Q9CWN7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cnot11Q9CWN7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cnot11Q9CWN7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cnot11Q9CWN7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cnot11Q9CWN7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cnot11Q9CWN7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot11Q9CWN7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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