Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhobtb3Q9CTN4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms