Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Fcf1Q9CTH6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Fcf1Q9CTH6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fcf1Q9CTH6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Fcf1Q9CTH6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Fcf1Q9CTH6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Fcf1Q9CTH6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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