Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rprd1bQ9CSU0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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