Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Mrpl35Q9CQL6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Mrpl35Q9CQL6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Mrpl35Q9CQL6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl35Q9CQL6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms