Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms