Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Atp6v0e1Q9CQD8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Atp6v0e1Q9CQD8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Atp6v0e1Q9CQD8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Atp6v0e1Q9CQD8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Atp6v0e1Q9CQD8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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