Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp2Q9CQ73 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms