Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssxb1Q9CPU1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssxb1Q9CPU1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Ssxb1Q9CPU1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssxb1Q9CPU1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ssxb1Q9CPU1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ssxb1Q9CPU1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ssxb1Q9CPU1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb1Q9CPU1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ssxb1Q9CPU1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb1Q9CPU1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb1Q9CPU1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb1Q9CPU1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb1Q9CPU1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ssxb1Q9CPU1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb1Q9CPU1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb1Q9CPU1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb1Q9CPU1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssxb1Q9CPU1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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