Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms