Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrbp1Q99PL5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrbp1Q99PL5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms