Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms