Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ubqln4Q99NB8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ubqln4Q99NB8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ubqln4Q99NB8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ubqln4Q99NB8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ubqln4Q99NB8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ubqln4Q99NB8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ubqln4Q99NB8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubqln4Q99NB8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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