Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdac9Q99N13 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hdac9Q99N13 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms