Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ms4a4dQ99N05 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ms4a4dQ99N05 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Ms4a4dQ99N05 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Ms4a4dQ99N05 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ms4a4dQ99N05 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Ms4a4dQ99N05 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ms4a4dQ99N05 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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