Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramel1Q99MW3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms