Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tdrd1Q99MV1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd1Q99MV1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tdrd1Q99MV1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tdrd1Q99MV1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tdrd1Q99MV1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tdrd1Q99MV1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tdrd1Q99MV1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd1Q99MV1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tdrd1Q99MV1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Tdrd1Q99MV1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Tdrd1Q99MV1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd1Q99MV1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Tdrd1Q99MV1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd1Q99MV1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd1Q99MV1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd1Q99MV1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd1Q99MV1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms