Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaipQ99ME3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaipQ99ME3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms