Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cstf3Q99LI7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms