Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RtcbQ99LF4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RtcbQ99LF4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms