Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcf2Q99LE6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcf2Q99LE6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms