Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q99KU6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q99KU6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q99KU6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q99KU6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q99KU6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q99KU6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q99KU6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q99KU6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q99KU6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q99KU6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q99KU6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q99KU6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q99KU6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q99KU6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q99KU6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q99KU6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q99KU6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q99KU6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q99KU6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q99KU6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q99KU6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q99KU6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q99KU6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q99KU6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q99KU6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q99KU6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q99KU6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q99KU6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q99KU6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q99KU6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q99KU6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q99KU6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q99KU6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q99KU6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q99KU6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q99KU6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q99KU6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q99KU6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q99KU6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q99KU6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q99KU6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q99KU6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q99KU6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q99KU6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q99KU6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms