Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpifQ99KR7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms