Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Reep3Q99KK1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms