Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd1bQ99JY6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms