Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spef1Q99JL1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms