Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacsin3Q99JB8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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