Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Apobec3Q99J72 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Apobec3Q99J72 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Apobec3Q99J72 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Apobec3Q99J72 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apobec3Q99J72 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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