Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tspan1Q99J59 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan1Q99J59 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan1Q99J59 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan1Q99J59 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan1Q99J59 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms