Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctu1Q99J10 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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