Protein–RNA interactions for Protein: Q925E0

Sntg2, Gamma-2-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg2Q925E0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sntg2Q925E0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg2Q925E0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg2Q925E0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg2Q925E0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg2Q925E0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg2Q925E0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg2Q925E0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg2Q925E0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg2Q925E0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg2Q925E0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg2Q925E0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg2Q925E0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg2Q925E0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg2Q925E0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg2Q925E0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sntg2Q925E0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.7 ms