Protein–RNA interactions for Protein: Q923W1

Tgs1, Trimethylguanosine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgs1Q923W1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgs1Q923W1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgs1Q923W1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms