Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csmd1Q923L3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms