Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb6Q922F4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms