Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpe65Q91ZQ5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms