Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpm2Q91YD4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trpm2Q91YD4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trpm2Q91YD4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trpm2Q91YD4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trpm2Q91YD4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trpm2Q91YD4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpm2Q91YD4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpm2Q91YD4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpm2Q91YD4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpm2Q91YD4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpm2Q91YD4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpm2Q91YD4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpm2Q91YD4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpm2Q91YD4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms