Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csde1Q91W50 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms