Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klc3Q91W40 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klc3Q91W40 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klc3Q91W40 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klc3Q91W40 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klc3Q91W40 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klc3Q91W40 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klc3Q91W40 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klc3Q91W40 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Klc3Q91W40 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klc3Q91W40 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Klc3Q91W40 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Klc3Q91W40 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klc3Q91W40 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klc3Q91W40 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klc3Q91W40 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Klc3Q91W40 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klc3Q91W40 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klc3Q91W40 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Klc3Q91W40 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klc3Q91W40 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klc3Q91W40 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klc3Q91W40 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms