Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmcd1Q8VEE1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmcd1Q8VEE1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms