Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cul7Q8VE73 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul7Q8VE73 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms