Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc39cQ8VE09 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc39cQ8VE09 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms