Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Stx18Q8VDS8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Stx18Q8VDS8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms